中华耳科学杂志,年19卷2期
第三代测序技术在遗传性耳聋基因拷贝数变异检测的临床应用
王秋权*莎莎袁永一
康东洋吴婕张昕戴朴拷贝数变异(copynumbervariations,CNVs)广泛存在于人类基因组中，是遗传变异的重要来源。其遗传致病机制包括基因剂量效应、位置效应等多种分子机制[1-4]。已有研究表明，CNVs也是遗传性耳聋的一个重要原因，占所有非综合征性耳聋分子病因的五分之一[5-8]，已成为遗传性耳聋分子诊断的主要检测内容之一。
过去研究人员提出的通过比较CNVs与标准参照基因之间相对值的检测技术，如多重链接探针扩增技术（MultiplexLigation-dependentProbeAmplification,MLPA），染色体微阵列分析技术（ChromosomalMicroarrayAnalysis,CMA），下一代测序技术（NextGenerationSequencing，NGS），尽管已经大幅提高了基因组的研究能力，但在分析CNVs等大片段结构性变异方面仍存在技术局限性。近年来出现的第三代测序技术(Third-GenerationSequencing，TGS)具有超长读长，快速，实时，高通量的优点，可以更直接有效准确地检测CNVs，确定CNVs片段长度等参考数据，精确定位CNVs位置，找到确切断点信息[9-11]。
本研究应用基于纳米孔（Nanopore）测序技术原理的TGS平台对1例耳聋伴有耳蜗分隔不全III型（In